上回说到人族三皇已满，五帝之治即将开始。
黄帝之孙颛顼，二十岁得黄帝传位为人皇。颛顼在位时，加强各部族间的融合，在截教强大的支持下强令禁绝从洪荒时代、人巫融合之后便一直流传下来的巫教，将许多小部落信奉的神明一概抹去，大力宣扬道门的正统性。
颛顼死之日，将帝位传于堂侄高辛氏姬喾。那帝喾生于穷桑，少小聪明好学，十二三岁便有盛名，十五而佐颛顼，封有辛地方，三十而得帝位，迁都毫邑，享寿百岁。帝师为人教玄都大法师所化的赤松子大仙，在位之时，人才济济，天下大治。
此后尧舜二帝相继而起，兴禅让，行德政，天下敬服。尧严肃恭谨，光照四方，上下分明，能团结族人，使邦族之间团结如一家，和睦相处。且为人简朴，吃粗米饭，喝野菜汤，自然便得到了百姓的爱戴。兴禅让，很好地解决了权力交替之时可能出现的动乱和不满。
舜娶尧二女为妻，受各部族推荐而为帝。增设官吏，知人善任，治下政通人和。设置谏言之鼓，让天下百姓尽其言；立诽谤之木，让天下百姓攻击他的过错。治天下五十余年，却终于在他为帝期间发生了一件危及天下百姓生死存亡的大事件，滔天的洪水暴发了。
却说五帝期间三教修士常往来四大部州，在人族中传道授徒，宣扬道法。又有颛顼大力宣扬道教，巫教既灭，道门正统地位无可撼动，香火日盛一日。
至巫妖大战之后，洪荒数百万妖族全部避居北俱芦洲。一时高手俱失，许多强大的法门神通不是随着大战消失，便是被带到了隐居之地。导致三大部州妖族一蹶不振。数万年来，北俱芦洲之外新生的小妖都只能修到妖王境界。所有的妖族也都认为妖王便是妖修的最高境界了。
这些妖族盘踞深山，划分地盘。因巫族与人族融合，秉持了巫妖血仇的新生妖族们便不断骚扰人族部落。人族在巫师们的带领下，也不断剿灭妖族。双方仇怨越积越大，普通人族对妖怪渐渐形成了恐惧和厌恶的心理，可说闻妖色变。
当然，也有妖族仗着变化之术混迹人间，普通人族也辨认不出。以其神通法术，一概认为神仙，享受了一些人间香火。
却说前时巫族支持的蚩尤争帝失败身死，刑天又被砍掉了头颅，在外的大巫相柳不知各中情况，大怒。相柳本是水之祖巫共工的大巫，控水之法无与伦比，因怒遂发洪水于天下，以警世人。相柳本意不过惩戒一番，聊以示威耳。奈何其本身神通广大，散落人间各个幽暗角落的妖族又不断兴风作浪，普通巫师也趁机推波助澜，发泄心头怨气。竟使得这场洪水声势越发浩大，越演越烈，渐渐不可收拾。
道教先也知是相柳只是想警戒一下世人，心下也确实有愧。起先便也听之任之，任由洪水泛滥。但见大水经久不息，百姓流离失所，苦不堪言，终于也忍不住了。三教圣人同时发旨，命弟子下山相助人皇治理洪水。又命弟子去墟山找到了帝虚，让他去约束相柳。帝虚也知此事再下去便过了，便前去把相柳抓了回来，象征性的惩罚他呆在祖巫殿。
然而洪水滔天之势已成。源头虽断，洪水一时却仍然无法消退。一时间，三教各显神通，巫妖并逞手段。三界再次热闹起来。
却说人间洪水肆虐，三教圣人命门下齐出，救助人族于危难之中。人教玄都大法师化身赤松子四处传道，普施符水，教民简朴安乐之道。阐教金仙在广成子的带领下径去求见人皇舜帝。声言要助人族斩妖除魔，治理水患。舜帝大喜，当下命手下能臣鲧为治水大臣，与阐教一众金仙同去治理洪水。
眼见洪水肆虐，鲧依过往经验，首先便想到深垒高墙将水堵住。阐教仙人一想，五行之中，土能克水，正该用堵的方法，遂欣然同意。广成子便自告奋勇的前去昆仑山请元始天尊去女娲娘娘处借来了息壤。
女娲娘娘对广成子说道：“今天下洪水滔滔，其中亦有不明事理的妖族后辈兴风作浪。其至恶者，杀之可也。有悔过者，你等也宜存好生之德，好生教导，网开一面。切不可一味打杀，致增罪孽。”
广成子连忙答应，取了九天息壤回转人族，将女娲娘娘之意告知众人。众人面面相觑，只得答应。心中却暗暗埋怨女娲娘娘偏袒妖族，遂对女娲之言不甚在意。一意只要斩妖除魔，在人族中树立阐教的正义形象。
当下阐教副教主灯道人率领一部分弟子外出寻找作恶的巫妖，将之打杀。广成子率领一部分弟子拿着九天息壤随鲧一起将水道堵塞，云中子居中调度协调。阐教金仙全力动作起来，一心要拿下这份救助人族的大功德。
堵的方法在开始时颇为有用。九天息壤用之不竭，可大可小，将鲧查找出的水患肆虐通道堵的严严实实。鲧等见此法有用，心中欣喜。广成子，灯等金仙更是卖力，仿佛看到了治水胜利的前景。
谁料好景不长，堤坝越筑越高，水也越蓄越深，九天息壤虽强，却也不可能将整个三大部洲完全护住。反而将危险蓄积起来，洪水终于在所有人都意想不到的时候冲破堤坝，再次席卷天下。并且越演越历，竟比上次危害更大，百姓苦不堪言。舜帝下旨严厉地申斥了鲧。却也知其确实尽了心的，因而此次只是严令鲧尽快想办法平息水患，并未过多责罚。
阐教一众金仙听了舜帝斥责鲧的诏，就像有人当面煽了自己几个大耳光一样，心里颇不是滋味。广成子等人一商量，觉得以土克水乃是五行正道，绝不会有错。那么问题当是出在那些兴风作浪的巫妖身上。
觉得颜面大失的阐教仙人当下大怒，四处寻找混迹在山林湖泽之中的妖族和巫师们的麻烦。一见之下，立马打杀，毫不留情。却是将女娲圣人的话忘在了脑后。
帝虚见人族大乱，其中有一些巫族之人便命刑天前去收拢巫族众人，其中有一个非天非地非神非人非鬼，亦非蠃非鳞非毛非羽非昆。又有四猴混世，不入十类之种的混世四猴之一的赤尻马猴淮水无支祁。无支祁本是共工坐下的大将，见相柳发水便在一旁推波助澜帮忙。
人族鲧受命治水，用围堵的办法，历经九年，收效甚微。洪水不时决口，百姓日日惊惶。阐教一众金仙亦无计可施。四方百姓心生怨愤，纷纷要求严惩治水无功的鲧。
舜帝于是巡视天下，所到之处，哀鸿遍野。心知必须要做一个交代了。于是昭告天下，责鲧失职之罪，处死于羽山之郊。百姓心中的愤怒这才平缓下来。
然而舜帝也知道这只是暂时的。若洪水不能得到有效的治理，百姓将继续受苦，天下始终不会安宁。当下便着力寻找可以继任鲧治理洪水之人。
有人进言道：“鲧之子禹有大才，治水本领青出于蓝可以用他前来治水。”禹乃是其父鲧死后的尸体中被人发现救出的，长大后明白其父死的原因也不怨恨舜帝，只是努力地研究如何治水。
舜帝也知鲧治水实在是尽了心的，为治水长年累月不回家。只是方法不对，没能成功。当下听到其子不仅继承了他的能力，而且青出于蓝便说道：“既如此，可叫禹来，由我当面考校一番。”
使臣传旨到禹家。禹长声大笑，其声悲呛。拈香遥祭其父，三叩而起，即领旨而去。至帝宫见舜，舜亲自考察禹的能力，见其果然胆识过人。当下大喜，即命禹继鲧之位，领生杀褫夺大权而治水。
大禹受命，仔细研究了父亲治水失败的原因，认为堵不如疏。当下在多宝等人帮助下，请见黄河之神河伯，求得记录了天下水地理图形的河图。依图治理水患，疏导山川，成效立显。
又有太上老子赐下开山斧和定海神针治水之力越加高强，大禹治水，经历数年之功，洪水渐渐受到控制。虽仍然凶猛，却不再四溢横流，天下稍安。
大禹理清山川地理，将天下河流分为九条大的流脉。又筑起九座高大的山脉，依地势重新划分九州。由是滚滚流水尽往东流，注入大海，天下水患平定。禹以其功德，受四方百姓尊敬，被舜帝定为自己的接班人。
水患已定，大禹地位也已经确立。在大禹治水功成之日，人族祭祀大殿之上天降功德，奖励大禹治水有功。阐教诸人也有一丝功德，却是他们也帮过治水，天道至公便发下一丝功德。
大禹在舜死后即位励精图治，还收集天下之铜铸造了九鼎镇压九州，建起九州结界。因九鼎之中各有一个龙子，故从此之后百姓便以龙的传人自称。而大禹死后皇位本是传给伯益，但是其子夏启不服，再加诸多大臣的帮助夺得了帝位，建立了大夏朝，从此从禅让制转向了家族制。
不说人族在大禹治水之后如何，天将发生一件大事。却是在轩辕大战蚩尤时天庭扬名于人族，这些年天庭人生鼎沸，也有了一丝兴盛之象。昊天与瑶池商议以蟠桃为名举行一届蟠桃盛会。此次昊天不管修为高低，只要已成仙便法力请柬，而且请了诸位圣人，当让身为紫微大帝，鸿钧老祖弟子的帝虚也是被请了，显然是昊天欲使天庭再扬名。
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